Cusco al 100%: Castillo 38.24%, Mendoza 20.30%, Lescano 9.98%, Soto 6.62% y López Aliaga 4.87%

La región imperial fue quizá el único feudo de Mendoza que resistió bien ante la llegada de Castillo debido a que es su región natal. Por su parte, Keiko Fujimori fue la sexta más votada en Cusco.
En 2016 aquellos pronósticos equivocados que indicaban que Verónika Mendoza obtendría un mal resultado en su región natal no se cumplieron, pero en 2021 sí se cumplieron. La lideresa cusqueña quedó a 18 puntos porcentuales del primer lugar ocupado por Pedro Castillo. No obstante, de cara a la segunda vuelta, es más que probable que Castillo gane con más de la mitad de los votos.
Pedro Castillo (Perú Libre) obtuvo 228,767 votos (38.23%), mientras que Verónika Mendoza (Juntos por el Perú) consiguió 121,442 votos (20.29%). El tercer lugar fue para Yonhy Lescano (Acción Popular) con 59,739 votos, siendo Cusco otra de las regiones donde gobierna el partido acciopopulista con Jean Paul Benavente a la cabeza.
El cuarto lugar fue para Hernando de Soto (Avanza País) con 39,603 votos (6.62%), mientras que Rafael López Aliaga (Renovación Popular) fue quinto con 29,140 votos (4.87%). Keiko Fujimori, al igual que en Arequipa, fue sexta en Cusco con 26,593 votos (4.44%). César Acuña (APP), por su parte, obtuvo el sétimo lugar con 15,772 votos (2.63%).
El resto de candidatos votados fueron George Forsyth (Victoria Nacional) con 13,766 votos (2.30%), Julio Guzmán (Partido Morado) con 9,063 votos (1.51%), Daniel Urresti (PP) con 8,508 votos (1.42%), Ciro Gálvez (RUNA) con 7,897 votos (1.32%), Ollanta Humala (Partido Nacionalista) con 6,788 votos (1.13%), José Vega (UPP) con 6,772 votos (1.13%), Alberto Beingolea (PPC) con 6,120 votos (1.02%), Marco Arana (Frente Amplio) con 5,663 votos (0.94%), Daniel Salaverry (Somos Perú) con 5,530 votos (0.92%), Andrés Alcántara (DD) con 5,080 votos (0.84%) y Rafael Santos (PPS) con 2,031 votos (0.33%).